Геномный секвенатор GS FLX+


Геномный секвенатор GS FLX+

Полная картина генома

Геномный секвенатор GS FLX+ – высокоскоростная и высокопроизводительная система секвенирования нового поколения для установления нуклеотидных последовательностей целых геномов. В основе работы GS FLX+ лежит технология 454 Sequencing, разработанная компанией 454 Life Sciences и базирующаяся на методе пиросеквенирования.

Широчайшая область применения

 

Cистема GS FLX+ открывает новые горизонты геномных исследований во всевозможных областях:

  • Секвенирование De Novo и сборкаПервичное полное секвенирование неизвестных геномов, транскриптомов и экзомов
  • Ресеквенирование и картирование Полногеномное и таргетное ресеквенирование, выявление и анализ SNP, делеций, вставок и различных структурных вариантов Анализ ассоциированных с заболеванием участков генома и популяционные исследования
  • Метагеномика и микробное разнообразие Секвенирование и анализ 16S рРНК Полногеномное секвенирование суммарной ДНК микрофлоры из окружающей среды
  • Анализ транскриптомов
  • Анализ метилирования ДНК
  • Палеогенетика

Уникальное сочетание длины прочтений, их качества и количества!

Преимущества

Высокая производительность в сочетании с максимальной на рынке длиной единичного прочтения – до 1000 п.о., позволяет:

  • получить более точный сиквенс
  • не потерять информацию о структурных вариантах, делециях и вставках при картировании на референс
  • точно определить микробный состав образца по метагеному
  • быстро осуществить анализ полученных результатов
  • осуществить путь от образца ДНК до публикуемого результата менее чем за неделю!

Возможность мультиплексирования образцов в одном запуске (более 2000 образцов)

  • Различные форматы пластины, конструкционно разделенные на 1, 2, 4, 8 или 16 участков, позволяют одновременно секвенировать несколько образцов.
  • Мультиплексные идентификаторы (MID) MID – синтетические олигонуклеотиды-метки, предусмотренные для секвенирования различного количества образцов в одном участке планшета. Существует основной набор из 12 MID, разработанный компанией 454. Возможно использовать расширенный набор из 141 дополнительного MID, спланированного пользователем.

Технология 3K, 8K, 20K Long-Tag Paired End

Эта технология позволяет прочитывать до 300 нуклеотидов с каждого конца отдельных фрагментов длиной 3, 8 или 20 тыс. нуклеотидов при одном считывании. Она значительно облегчает De Novo сборку геномов и обеспечивает высокую точность разрешения при изучении различных структурных вариантов, в том числе вставок, делеций, инверсий, повторов, изменения числа копий и т.д.

 

Решение от начала до конца – от генерирования данных до биологически значимого результата

Инновационная технология пиросеквенирования 454 уже позволила опубликовать тысячи научных работ в рецензируемых журналах (my454.com).

Удобное в использовании и простое программное обеспечение для анализа данных и протоколы проводят Вас от данных секвенирования до публикуемого результата.

Вам не нужно быть специалистом в области ИТ или экспертом в биоинформатике, чтобы получить биологически ценный результат и полностью решить Ваши научные задачи.

 

Простой анализ данных

Все данные, полученные на системе GS FLX+ обрабатываются на компьютере, входящем в комплект системы. В компьютере установлено интуитивное программное обеспечение с графическим интерфейсом, исключающее необходимость использования командной строки или дорогостоящего суперкомпьютера. Сделайте все сами при помощи одной системы - от генерирования данных до биологического открытия, при помощи модулей программного обеспечения GS FLX+:

  • GS De Novo Assembler “Newbler” – для сборки De Novo
  • GS Reference Mapper – для картирования на референсную последовательность

Комплектация

Прибор GS FLX+

Компьютер, монитор и программное обеспечение для анализа данных GS Analysis Software

Устройство для загрузки частиц GS FLX+ Bead Deposition Device

Противовес GS FLX+ Bead Deposition Device Counterweight

Разъем для стенной розетки

Защита камеры

Адаптеры для шейкера

Соединительный кабель

Сетевой кабель

Основные характеристики

Производительность

до 1 млрд. нуклеотидов за один запуск прибора

 

Время запуска

23 часа 


Длина отдельных прочтений

Модальная длина 700 п.о.

Средняя длина более 600 п.о.

 

Точность

Точность консенсуса 99.997%

 

Количество прочтений за один запуск

~1,000,000 прочтений

 

Образец

Геномная ДНК, ампликоны, кДНК, BAC

 

Размеры

74.3 см х 69.8 см х 36.1 см

 

Компьютер

Операционная система Linux в компьютере HP входят в систему.