Система GS Junior


Система GS Junior

Система GS Junior System переносит мощь технологии 454 Sequencing на ваш рабочий стол. Вы быстро пройдете путь от ДНК к обработке данных и к научному открытию благодаря простой пробоподготовке, проводящемуся за ночь секвенированию и интуитвно понятному программному обеспечению.

GS Junior – это секвенатор нового поколения. В основе работы GS Junior лежит технология 454 Sequencing, разработанная компанией 454 Life Sciences и базирующаяся на методе пиросеквенирования. С 2005 года эта технология по праву считается «Золотым стандартом» секвенирования нового поколения. Прибор GS Junior идеально подходит для небольших лабораторий: размером с принтер, он не требует много места и прекрасно разместится на Вашем лабораторном столе.

Идеально подходит для лабораторий, которым требуется:

  • Прямое, клональное секвенирование ампликонов (ПЦР-продуктов)
  • Таргетное ресеквенирование участков генома
  • De novo секвенирование микробных и вирусных геномов
  • Исследование метагеномов сложных образцов различной природы
  • Детекция патогенов
  • Сверхглубокое секвенирование ампликонов с целью поиска редких соматических мутаций
  • Поиск минорных вариаций ВИЧ, вирусных гепатитов, гаплотипирование

...и многое другое с системой GS Junior!


Преимущества

Новая система – проверенная временем технология

Беспрецедентная для настольных секвенаторов длина единичного прочтения (в среднем 450 п.о.) позволяет:

  • получить более точный сиквенс
  • не потерять информацию о структурных вариантах, делециях и вставках при картировании на референс
  • точно определить микробный состав по метагеному образца
  • определить гаплотип (например HLA-типирование)
  • секвенировать протяженные ампликоны, в том числе и двусторонними прочтениями (по 450 п.о. в каждом направлении) для большей точности сиквенса
  • быстро осуществить анализ полученных результатов
  • осуществить путь от образца ДНК до публикуемого результата менее чем за 3 дня!

Возможность мультиплексирования образцов в одном запуске (до 153 образцов)

Решение от начала до конца – от генерирования данных до биологически значимого результата

Инновационная технология пиросеквенирования 454 уже позволила опубликовать тысячи научных работ в рецензируемых журналах (my454.com).

Удобное в использовании и простое программное обеспечение для анализа данных и протоколы проводят Вас от данных секвенирования до публикуемого результата.

Вам не нужно быть специалистом в области ИТ или экспертом в биоинформатике, чтобы получить биологически ценный результат и полностью решить Ваши научные задачи.

Простой анализ данных

Все данные, полученные на системе GS Junior обрабатываются на компьютере, входящем в комплект системы. В компьютере установлено интуитивное программное обеспечение с графическим интерфейсом, исключающее необходимость использования командной строки или дорогостоящего суперкомпьютера. Сделайте все сами при помощи одной системы - от генерирования данных до биологического открытия, при помощи модулей программного обеспечения GS Junior:

  • GS De Novo Assembler “Newbler” – для сборки De Novo
  • GS Reference Mapper – для картирования на референсную последовательность
  • GS Amplicon Variant Analyzer – для анализа ампликонов

Комплектация

  • прибор GS Junior,
  • компьютер, монитор и программное обеспечение для анализа данных GS Analysis Software
  • устройство для загрузки частиц GS Junior Bead Deposition Device
  • счетчик частиц GS Junior Bead Counter
  • противовеса GS Junior Bead Deposition Device Counterweight и адаптеры для центрифуги
  • соединительный кабель
  • сетевой кабель
  • шейкер IKA Turrax

Основные характеристики

Производительность 

 > 40 миллионов высококачественных, отфильтрованных нуклеотидов за один запуск*

Время запуска 

10 часов – секвенирование и первичная обработка данных

Длина отдельных прочтений

Модальная длина более 500 нуклеотидов

Средняя длина более 400 нуклеотидов*

Точность

Длина прочтений Q20= 400 нуклеотидов

(Точность 99% для 400 нуклеотидов)

Количество прочтений за один запуск прибора

100 000 прочтений (в среднем)*

Образец

Геномная ДНК, ампликоны, кДНК, BAC

Размеры 

40 см (ширина) x 60 см (глубина) x 40 см (высота)

(размер лазерного принтера)

Компьютер

Операционная система Linux в компьютере HP входят в систему.

* Типичные результаты. Средняя длина прочтений и количество прочтений зависит от образца и характеристик генома.